Protein–RNA interactions for Protein: Q05397

PTK2, Focal adhesion kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK2Q05397 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTK2Q05397 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTK2Q05397 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTK2Q05397 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PTK2Q05397 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTK2Q05397 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTK2Q05397 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTK2Q05397 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTK2Q05397 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTK2Q05397 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTK2Q05397 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTK2Q05397 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTK2Q05397 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTK2Q05397 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTK2Q05397 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTK2Q05397 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTK2Q05397 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTK2Q05397 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTK2Q05397 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PTK2Q05397 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTK2Q05397 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTK2Q05397 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTK2Q05397 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTK2Q05397 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTK2Q05397 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTK2Q05397 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTK2Q05397 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTK2Q05397 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTK2Q05397 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTK2Q05397 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTK2Q05397 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTK2Q05397 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTK2Q05397 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTK2Q05397 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PTK2Q05397 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PTK2Q05397 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTK2Q05397 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTK2Q05397 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTK2Q05397 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTK2Q05397 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTK2Q05397 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTK2Q05397 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTK2Q05397 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms