Protein–RNA interactions for Protein: Q01826

SATB1, DNA-binding protein SATB1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB1Q01826 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms