Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 709 ms