Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDK6Q00534 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDK6Q00534 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDK6Q00534 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDK6Q00534 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK6Q00534 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK6Q00534 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK6Q00534 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK6Q00534 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK6Q00534 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK6Q00534 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK6Q00534 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK6Q00534 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK6Q00534 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK6Q00534 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK6Q00534 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK6Q00534 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK6Q00534 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK6Q00534 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK6Q00534 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK6Q00534 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK6Q00534 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK6Q00534 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK6Q00534 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK6Q00534 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK6Q00534 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK6Q00534 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK6Q00534 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK6Q00534 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK6Q00534 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK6Q00534 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK6Q00534 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK6Q00534 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK6Q00534 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDK6Q00534 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDK6Q00534 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDK6Q00534 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDK6Q00534 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDK6Q00534 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDK6Q00534 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDK6Q00534 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDK6Q00534 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDK6Q00534 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms