Protein–RNA interactions for Protein: P78549

NTHL1, Endonuclease III-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTHL1P78549 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NTHL1P78549 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NTHL1P78549 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NTHL1P78549 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NTHL1P78549 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NTHL1P78549 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NTHL1P78549 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NTHL1P78549 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NTHL1P78549 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NTHL1P78549 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NTHL1P78549 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NTHL1P78549 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NTHL1P78549 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NTHL1P78549 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NTHL1P78549 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NTHL1P78549 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NTHL1P78549 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NTHL1P78549 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NTHL1P78549 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NTHL1P78549 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NTHL1P78549 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NTHL1P78549 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NTHL1P78549 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NTHL1P78549 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NTHL1P78549 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NTHL1P78549 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NTHL1P78549 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NTHL1P78549 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NTHL1P78549 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NTHL1P78549 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NTHL1P78549 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NTHL1P78549 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NTHL1P78549 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NTHL1P78549 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NTHL1P78549 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NTHL1P78549 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NTHL1P78549 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NTHL1P78549 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NTHL1P78549 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NTHL1P78549 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NTHL1P78549 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NTHL1P78549 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NTHL1P78549 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NTHL1P78549 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NTHL1P78549 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NTHL1P78549 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NTHL1P78549 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NTHL1P78549 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NTHL1P78549 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NTHL1P78549 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NTHL1P78549 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NTHL1P78549 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NTHL1P78549 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NTHL1P78549 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms