Protein–RNA interactions for Protein: P62979

RPS27A, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS27AP62979 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPS27AP62979 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPS27AP62979 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPS27AP62979 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPS27AP62979 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPS27AP62979 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPS27AP62979 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPS27AP62979 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPS27AP62979 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RPS27AP62979 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPS27AP62979 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPS27AP62979 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPS27AP62979 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPS27AP62979 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPS27AP62979 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPS27AP62979 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPS27AP62979 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPS27AP62979 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPS27AP62979 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPS27AP62979 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPS27AP62979 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPS27AP62979 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPS27AP62979 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPS27AP62979 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPS27AP62979 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPS27AP62979 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPS27AP62979 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPS27AP62979 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPS27AP62979 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPS27AP62979 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPS27AP62979 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPS27AP62979 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPS27AP62979 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPS27AP62979 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPS27AP62979 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS27AP62979 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS27AP62979 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS27AP62979 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS27AP62979 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS27AP62979 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS27AP62979 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS27AP62979 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS27AP62979 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS27AP62979 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS27AP62979 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS27AP62979 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS27AP62979 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS27AP62979 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS27AP62979 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS27AP62979 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS27AP62979 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS27AP62979 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS27AP62979 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS27AP62979 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS27AP62979 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS27AP62979 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS27AP62979 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS27AP62979 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS27AP62979 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS27AP62979 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS27AP62979 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS27AP62979 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS27AP62979 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS27AP62979 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS27AP62979 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS27AP62979 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS27AP62979 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS27AP62979 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS27AP62979 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS27AP62979 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS27AP62979 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS27AP62979 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS27AP62979 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS27AP62979 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS27AP62979 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS27AP62979 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS27AP62979 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS27AP62979 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS27AP62979 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS27AP62979 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS27AP62979 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS27AP62979 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS27AP62979 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS27AP62979 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS27AP62979 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS27AP62979 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS27AP62979 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS27AP62979 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS27AP62979 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS27AP62979 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS27AP62979 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS27AP62979 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS27AP62979 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS27AP62979 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS27AP62979 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS27AP62979 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS27AP62979 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS27AP62979 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS27AP62979 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS27AP62979 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms