Protein–RNA interactions for Protein: P62877

RBX1, E3 ubiquitin-protein ligase RBX1, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBX1P62877 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBX1P62877 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBX1P62877 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RBX1P62877 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RBX1P62877 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBX1P62877 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBX1P62877 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBX1P62877 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBX1P62877 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBX1P62877 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBX1P62877 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBX1P62877 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBX1P62877 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBX1P62877 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBX1P62877 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RBX1P62877 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBX1P62877 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBX1P62877 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBX1P62877 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBX1P62877 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBX1P62877 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBX1P62877 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBX1P62877 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBX1P62877 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBX1P62877 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBX1P62877 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBX1P62877 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBX1P62877 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBX1P62877 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBX1P62877 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBX1P62877 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBX1P62877 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBX1P62877 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBX1P62877 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBX1P62877 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBX1P62877 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RBX1P62877 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBX1P62877 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBX1P62877 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBX1P62877 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBX1P62877 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBX1P62877 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBX1P62877 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBX1P62877 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBX1P62877 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBX1P62877 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBX1P62877 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBX1P62877 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBX1P62877 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBX1P62877 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBX1P62877 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBX1P62877 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBX1P62877 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBX1P62877 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBX1P62877 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBX1P62877 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBX1P62877 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBX1P62877 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBX1P62877 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBX1P62877 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBX1P62877 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBX1P62877 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBX1P62877 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBX1P62877 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBX1P62877 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBX1P62877 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBX1P62877 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBX1P62877 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBX1P62877 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RBX1P62877 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBX1P62877 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBX1P62877 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBX1P62877 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBX1P62877 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBX1P62877 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBX1P62877 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBX1P62877 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBX1P62877 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBX1P62877 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBX1P62877 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBX1P62877 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBX1P62877 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBX1P62877 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBX1P62877 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBX1P62877 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBX1P62877 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBX1P62877 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBX1P62877 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBX1P62877 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBX1P62877 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBX1P62877 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBX1P62877 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBX1P62877 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBX1P62877 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBX1P62877 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBX1P62877 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBX1P62877 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBX1P62877 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBX1P62877 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBX1P62877 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms