Protein–RNA interactions for Protein: P62760

VSNL1, Visinin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSNL1P62760 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms