Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UFM1P61960 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
UFM1P61960 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UFM1P61960 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UFM1P61960 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UFM1P61960 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UFM1P61960 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UFM1P61960 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UFM1P61960 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UFM1P61960 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UFM1P61960 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UFM1P61960 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UFM1P61960 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UFM1P61960 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UFM1P61960 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UFM1P61960 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UFM1P61960 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UFM1P61960 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UFM1P61960 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UFM1P61960 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
UFM1P61960 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UFM1P61960 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UFM1P61960 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UFM1P61960 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UFM1P61960 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UFM1P61960 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UFM1P61960 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UFM1P61960 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UFM1P61960 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UFM1P61960 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UFM1P61960 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UFM1P61960 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UFM1P61960 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UFM1P61960 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UFM1P61960 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UFM1P61960 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UFM1P61960 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UFM1P61960 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UFM1P61960 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UFM1P61960 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UFM1P61960 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UFM1P61960 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UFM1P61960 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UFM1P61960 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UFM1P61960 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UFM1P61960 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UFM1P61960 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UFM1P61960 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UFM1P61960 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UFM1P61960 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UFM1P61960 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UFM1P61960 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UFM1P61960 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UFM1P61960 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UFM1P61960 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UFM1P61960 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UFM1P61960 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UFM1P61960 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UFM1P61960 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UFM1P61960 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UFM1P61960 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UFM1P61960 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UFM1P61960 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UFM1P61960 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
UFM1P61960 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
UFM1P61960 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
UFM1P61960 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UFM1P61960 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UFM1P61960 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UFM1P61960 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UFM1P61960 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UFM1P61960 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UFM1P61960 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UFM1P61960 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UFM1P61960 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UFM1P61960 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UFM1P61960 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UFM1P61960 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UFM1P61960 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UFM1P61960 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UFM1P61960 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UFM1P61960 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
UFM1P61960 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
UFM1P61960 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UFM1P61960 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UFM1P61960 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UFM1P61960 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UFM1P61960 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UFM1P61960 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UFM1P61960 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UFM1P61960 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UFM1P61960 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UFM1P61960 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UFM1P61960 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UFM1P61960 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UFM1P61960 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UFM1P61960 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UFM1P61960 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UFM1P61960 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UFM1P61960 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms