Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVK-21P61565 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVK-21P61565 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVK-21P61565 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVK-21P61565 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVK-21P61565 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVK-21P61565 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVK-21P61565 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVK-21P61565 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVK-21P61565 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVK-21P61565 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVK-21P61565 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVK-21P61565 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVK-21P61565 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVK-21P61565 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVK-21P61565 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVK-21P61565 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVK-21P61565 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVK-21P61565 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVK-21P61565 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVK-21P61565 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVK-21P61565 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVK-21P61565 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVK-21P61565 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVK-21P61565 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVK-21P61565 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVK-21P61565 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVK-21P61565 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVK-21P61565 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVK-21P61565 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVK-21P61565 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVK-21P61565 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVK-21P61565 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVK-21P61565 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVK-21P61565 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVK-21P61565 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVK-21P61565 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVK-21P61565 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVK-21P61565 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVK-21P61565 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVK-21P61565 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVK-21P61565 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVK-21P61565 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVK-21P61565 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVK-21P61565 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVK-21P61565 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVK-21P61565 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVK-21P61565 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVK-21P61565 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVK-21P61565 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVK-21P61565 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVK-21P61565 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVK-21P61565 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVK-21P61565 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVK-21P61565 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVK-21P61565 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERVK-21P61565 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ERVK-21P61565 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERVK-21P61565 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ERVK-21P61565 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ERVK-21P61565 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ERVK-21P61565 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ERVK-21P61565 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ERVK-21P61565 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ERVK-21P61565 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ERVK-21P61565 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ERVK-21P61565 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERVK-21P61565 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ERVK-21P61565 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERVK-21P61565 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVK-21P61565 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVK-21P61565 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVK-21P61565 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVK-21P61565 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVK-21P61565 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVK-21P61565 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVK-21P61565 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVK-21P61565 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVK-21P61565 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVK-21P61565 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVK-21P61565 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVK-21P61565 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVK-21P61565 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVK-21P61565 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVK-21P61565 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVK-21P61565 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVK-21P61565 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVK-21P61565 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVK-21P61565 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVK-21P61565 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVK-21P61565 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVK-21P61565 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVK-21P61565 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVK-21P61565 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVK-21P61565 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVK-21P61565 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVK-21P61565 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVK-21P61565 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVK-21P61565 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVK-21P61565 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms