Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SNAP25P60880 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNAP25P60880 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNAP25P60880 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNAP25P60880 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNAP25P60880 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNAP25P60880 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNAP25P60880 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNAP25P60880 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNAP25P60880 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNAP25P60880 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNAP25P60880 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNAP25P60880 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNAP25P60880 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNAP25P60880 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNAP25P60880 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNAP25P60880 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNAP25P60880 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNAP25P60880 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNAP25P60880 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SNAP25P60880 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SNAP25P60880 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SNAP25P60880 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNAP25P60880 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNAP25P60880 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNAP25P60880 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNAP25P60880 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNAP25P60880 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNAP25P60880 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNAP25P60880 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNAP25P60880 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNAP25P60880 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNAP25P60880 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNAP25P60880 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNAP25P60880 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNAP25P60880 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SNAP25P60880 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNAP25P60880 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNAP25P60880 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNAP25P60880 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNAP25P60880 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNAP25P60880 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNAP25P60880 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNAP25P60880 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNAP25P60880 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNAP25P60880 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNAP25P60880 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNAP25P60880 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNAP25P60880 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNAP25P60880 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNAP25P60880 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNAP25P60880 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNAP25P60880 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNAP25P60880 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SNAP25P60880 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SNAP25P60880 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNAP25P60880 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms