Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms