Protein–RNA interactions for Protein: P58546

MTPN, Myotrophin, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTPNP58546 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MTPNP58546 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MTPNP58546 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MTPNP58546 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MTPNP58546 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MTPNP58546 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MTPNP58546 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MTPNP58546 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MTPNP58546 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
MTPNP58546 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
MTPNP58546 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MTPNP58546 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
MTPNP58546 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MTPNP58546 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MTPNP58546 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MTPNP58546 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MTPNP58546 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MTPNP58546 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MTPNP58546 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MTPNP58546 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MTPNP58546 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MTPNP58546 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MTPNP58546 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MTPNP58546 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MTPNP58546 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MTPNP58546 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MTPNP58546 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MTPNP58546 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MTPNP58546 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MTPNP58546 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MTPNP58546 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MTPNP58546 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MTPNP58546 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MTPNP58546 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MTPNP58546 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MTPNP58546 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MTPNP58546 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MTPNP58546 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MTPNP58546 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MTPNP58546 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MTPNP58546 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MTPNP58546 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MTPNP58546 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MTPNP58546 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MTPNP58546 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MTPNP58546 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MTPNP58546 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MTPNP58546 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MTPNP58546 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MTPNP58546 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTPNP58546 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTPNP58546 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTPNP58546 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTPNP58546 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTPNP58546 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTPNP58546 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTPNP58546 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTPNP58546 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTPNP58546 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTPNP58546 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTPNP58546 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTPNP58546 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTPNP58546 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTPNP58546 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTPNP58546 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTPNP58546 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTPNP58546 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MTPNP58546 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MTPNP58546 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MTPNP58546 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MTPNP58546 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MTPNP58546 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MTPNP58546 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
MTPNP58546 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MTPNP58546 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MTPNP58546 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MTPNP58546 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MTPNP58546 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MTPNP58546 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MTPNP58546 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MTPNP58546 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MTPNP58546 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MTPNP58546 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MTPNP58546 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MTPNP58546 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MTPNP58546 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MTPNP58546 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MTPNP58546 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MTPNP58546 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MTPNP58546 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MTPNP58546 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MTPNP58546 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
MTPNP58546 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MTPNP58546 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MTPNP58546 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MTPNP58546 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MTPNP58546 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MTPNP58546 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MTPNP58546 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MTPNP58546 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms