Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LOXL3P58215 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms