Protein–RNA interactions for Protein: P56282

POLE2, DNA polymerase epsilon subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE2P56282 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLE2P56282 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POLE2P56282 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLE2P56282 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLE2P56282 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLE2P56282 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLE2P56282 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POLE2P56282 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLE2P56282 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLE2P56282 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.29■■□□□ 1
POLE2P56282 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POLE2P56282 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.29■■□□□ 1
POLE2P56282 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLE2P56282 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLE2P56282 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLE2P56282 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.29■■□□□ 1
POLE2P56282 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLE2P56282 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLE2P56282 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
POLE2P56282 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLE2P56282 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POLE2P56282 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLE2P56282 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
POLE2P56282 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLE2P56282 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLE2P56282 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLE2P56282 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLE2P56282 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
POLE2P56282 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
POLE2P56282 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLE2P56282 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLE2P56282 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POLE2P56282 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POLE2P56282 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
POLE2P56282 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLE2P56282 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLE2P56282 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POLE2P56282 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
POLE2P56282 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLE2P56282 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLE2P56282 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLE2P56282 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
POLE2P56282 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLE2P56282 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLE2P56282 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POLE2P56282 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLE2P56282 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLE2P56282 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POLE2P56282 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLE2P56282 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
POLE2P56282 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POLE2P56282 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POLE2P56282 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POLE2P56282 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
POLE2P56282 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLE2P56282 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
POLE2P56282 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
POLE2P56282 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLE2P56282 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLE2P56282 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLE2P56282 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLE2P56282 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLE2P56282 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLE2P56282 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLE2P56282 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLE2P56282 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLE2P56282 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLE2P56282 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLE2P56282 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLE2P56282 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLE2P56282 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLE2P56282 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLE2P56282 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLE2P56282 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLE2P56282 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLE2P56282 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLE2P56282 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLE2P56282 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLE2P56282 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLE2P56282 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLE2P56282 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLE2P56282 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLE2P56282 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLE2P56282 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLE2P56282 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLE2P56282 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLE2P56282 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLE2P56282 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLE2P56282 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLE2P56282 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLE2P56282 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLE2P56282 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLE2P56282 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLE2P56282 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLE2P56282 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
POLE2P56282 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLE2P56282 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLE2P56282 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLE2P56282 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLE2P56282 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms