Protein–RNA interactions for Protein: P55327

TPD52, Tumor protein D52, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52P55327 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TPD52P55327 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TPD52P55327 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TPD52P55327 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TPD52P55327 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TPD52P55327 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TPD52P55327 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TPD52P55327 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TPD52P55327 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TPD52P55327 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TPD52P55327 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TPD52P55327 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TPD52P55327 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TPD52P55327 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TPD52P55327 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TPD52P55327 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TPD52P55327 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TPD52P55327 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TPD52P55327 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TPD52P55327 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TPD52P55327 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TPD52P55327 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TPD52P55327 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TPD52P55327 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TPD52P55327 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TPD52P55327 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TPD52P55327 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPD52P55327 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPD52P55327 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPD52P55327 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPD52P55327 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPD52P55327 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPD52P55327 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPD52P55327 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPD52P55327 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPD52P55327 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPD52P55327 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPD52P55327 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TPD52P55327 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPD52P55327 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPD52P55327 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPD52P55327 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPD52P55327 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPD52P55327 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPD52P55327 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPD52P55327 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPD52P55327 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPD52P55327 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPD52P55327 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPD52P55327 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPD52P55327 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPD52P55327 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPD52P55327 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TPD52P55327 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPD52P55327 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPD52P55327 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPD52P55327 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPD52P55327 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TPD52P55327 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
TPD52P55327 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TPD52P55327 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TPD52P55327 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TPD52P55327 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
TPD52P55327 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPD52P55327 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPD52P55327 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPD52P55327 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPD52P55327 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPD52P55327 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPD52P55327 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPD52P55327 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPD52P55327 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPD52P55327 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPD52P55327 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPD52P55327 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPD52P55327 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPD52P55327 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPD52P55327 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPD52P55327 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPD52P55327 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPD52P55327 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPD52P55327 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPD52P55327 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPD52P55327 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPD52P55327 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPD52P55327 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPD52P55327 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPD52P55327 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPD52P55327 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPD52P55327 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TPD52P55327 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPD52P55327 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPD52P55327 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPD52P55327 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPD52P55327 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPD52P55327 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPD52P55327 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPD52P55327 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPD52P55327 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPD52P55327 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms