Protein–RNA interactions for Protein: P55087

AQP4, Aquaporin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AQP4P55087 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AQP4P55087 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AQP4P55087 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AQP4P55087 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AQP4P55087 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AQP4P55087 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AQP4P55087 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AQP4P55087 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AQP4P55087 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AQP4P55087 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AQP4P55087 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AQP4P55087 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
AQP4P55087 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AQP4P55087 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AQP4P55087 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AQP4P55087 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AQP4P55087 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AQP4P55087 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AQP4P55087 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AQP4P55087 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AQP4P55087 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AQP4P55087 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AQP4P55087 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AQP4P55087 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AQP4P55087 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AQP4P55087 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AQP4P55087 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AQP4P55087 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AQP4P55087 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AQP4P55087 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AQP4P55087 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AQP4P55087 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AQP4P55087 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AQP4P55087 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AQP4P55087 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AQP4P55087 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AQP4P55087 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AQP4P55087 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AQP4P55087 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AQP4P55087 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AQP4P55087 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AQP4P55087 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AQP4P55087 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AQP4P55087 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AQP4P55087 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AQP4P55087 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AQP4P55087 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AQP4P55087 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AQP4P55087 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AQP4P55087 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AQP4P55087 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AQP4P55087 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
AQP4P55087 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AQP4P55087 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AQP4P55087 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AQP4P55087 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AQP4P55087 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AQP4P55087 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AQP4P55087 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AQP4P55087 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AQP4P55087 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AQP4P55087 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AQP4P55087 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AQP4P55087 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AQP4P55087 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AQP4P55087 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AQP4P55087 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AQP4P55087 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AQP4P55087 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AQP4P55087 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AQP4P55087 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AQP4P55087 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AQP4P55087 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AQP4P55087 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AQP4P55087 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AQP4P55087 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AQP4P55087 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AQP4P55087 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AQP4P55087 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AQP4P55087 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AQP4P55087 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
AQP4P55087 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AQP4P55087 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AQP4P55087 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AQP4P55087 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AQP4P55087 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AQP4P55087 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AQP4P55087 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AQP4P55087 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AQP4P55087 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AQP4P55087 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AQP4P55087 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AQP4P55087 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AQP4P55087 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AQP4P55087 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AQP4P55087 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AQP4P55087 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AQP4P55087 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
AQP4P55087 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AQP4P55087 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms