Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms