Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HIRAP54198 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HIRAP54198 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HIRAP54198 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HIRAP54198 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HIRAP54198 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HIRAP54198 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HIRAP54198 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HIRAP54198 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HIRAP54198 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
HIRAP54198 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HIRAP54198 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HIRAP54198 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HIRAP54198 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HIRAP54198 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HIRAP54198 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HIRAP54198 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HIRAP54198 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HIRAP54198 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HIRAP54198 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HIRAP54198 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HIRAP54198 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HIRAP54198 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HIRAP54198 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HIRAP54198 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HIRAP54198 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HIRAP54198 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HIRAP54198 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
HIRAP54198 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
HIRAP54198 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
HIRAP54198 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HIRAP54198 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HIRAP54198 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HIRAP54198 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HIRAP54198 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HIRAP54198 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HIRAP54198 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HIRAP54198 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HIRAP54198 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
HIRAP54198 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HIRAP54198 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HIRAP54198 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
HIRAP54198 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HIRAP54198 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HIRAP54198 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HIRAP54198 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HIRAP54198 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HIRAP54198 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HIRAP54198 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HIRAP54198 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
HIRAP54198 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HIRAP54198 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HIRAP54198 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
HIRAP54198 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HIRAP54198 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HIRAP54198 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HIRAP54198 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HIRAP54198 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HIRAP54198 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HIRAP54198 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HIRAP54198 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HIRAP54198 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HIRAP54198 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HIRAP54198 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HIRAP54198 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HIRAP54198 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HIRAP54198 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HIRAP54198 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HIRAP54198 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HIRAP54198 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HIRAP54198 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HIRAP54198 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HIRAP54198 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HIRAP54198 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HIRAP54198 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HIRAP54198 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HIRAP54198 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HIRAP54198 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HIRAP54198 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HIRAP54198 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HIRAP54198 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HIRAP54198 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HIRAP54198 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HIRAP54198 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HIRAP54198 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HIRAP54198 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HIRAP54198 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HIRAP54198 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HIRAP54198 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HIRAP54198 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HIRAP54198 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HIRAP54198 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HIRAP54198 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HIRAP54198 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HIRAP54198 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HIRAP54198 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HIRAP54198 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
HIRAP54198 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HIRAP54198 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HIRAP54198 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms