Protein–RNA interactions for Protein: P53847

DSL1, Protein transport protein DSL1, yeast

Predictions only

Length 754 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSL1	P53847	FAT1	YBR041W	2010 nt		3.71	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	YDR034C-C	YDR034C-C	1317 nt		3.71	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	YLR410W-A	YLR410W-A	1317 nt		3.71	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	MGT1	YDL200C	567 nt		3.71	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	SHR3	YDL212W	633 nt		3.71	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	RSM26	YJR101W	801 nt		3.71	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	LDS2	YOL047C	1071 nt		3.71	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	DCP1	YOL149W	696 nt		3.71	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	ATG5	YPL149W	885 nt		3.71	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	ACA1	YER045C	1470 nt		3.71	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	FAS1	YKL182W	6156 nt		3.71	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	RAD4	YER162C	2265 nt		3.7	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	MTR4	YJL050W	3222 nt		3.7	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	BUD6	YLR319C	2367 nt		3.7	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	PIB1	YDR313C	861 nt		3.7	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	MAG1	YER142C	891 nt		3.7	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	BNA1	YJR025C	534 nt		3.7	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	MTR2	YKL186C	555 nt		3.7	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	YML047W-A	YML047W-A	366 nt		3.7	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	YML094C-A	YML094C-A	402 nt		3.7	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	IST1	YNL265C	897 nt		3.7	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	COS1	YNL336W	1146 nt		3.7	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	RPC34	YNR003C	954 nt		3.7	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	PLP2	YOR281C	861 nt		3.7	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	HSH49	YOR319W	642 nt		3.7	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	ECM8	YBR076W	1065 nt		3.7	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	YBR292C	YBR292C	372 nt		3.7	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	YOL019W	YOL019W	1656 nt		3.7	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	KIN2	YLR096W	3444 nt		3.7	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	SSM4	YIL030C	3960 nt		3.7	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	BAR1	YIL015W	1764 nt		3.69	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	PRS5	YOL061W	1491 nt		3.69	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	YEL053W-A	YEL053W-A	348 nt		3.69	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	HIS5	YIL116W	1158 nt		3.69	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	BAT2	YJR148W	1131 nt		3.69	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	YML116W-A	YML116W-A	303 nt		3.69	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	SSU72	YNL222W	621 nt		3.69	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	PFK27	YOL136C	1194 nt		3.69	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	YBR013C	YBR013C	390 nt		3.69	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	YOR263C	YOR263C	408 nt		3.69	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	YPL168W	YPL168W	1293 nt		3.69	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	AZR1	YGR224W	1842 nt		3.69	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	YAK1	YJL141C	2424 nt		3.69	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	YNR066C	YNR066C	1311 nt		3.69	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	MAL12	YGR292W	1755 nt		3.68	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	MAL32	YBR299W	1755 nt		3.68	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	TSR1	YDL060W	2367 nt		3.68	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	RTG3	YBL103C	1461 nt		3.68	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	HIM1	YDR317W	1245 nt		3.68	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	SPT3	YDR392W	1014 nt		3.68	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	YFR032C-B	YFR032C-B	264 nt		3.68	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	CAB2	YIL083C	1098 nt		3.68	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	YLR169W	YLR169W	354 nt		3.68	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	FDH1	YOR388C	1131 nt		3.68	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	ICS2	YBR157C	768 nt		3.68	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	USA1	YML029W	2517 nt		3.68	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	URC2	YDR520C	2319 nt		3.67	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	NUF2	YOL069W	1356 nt		3.67	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	RPL35B	YDL136W	363 nt		3.67	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	YDL157C	YDL157C	357 nt		3.67	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	RPS18A	YDR450W	441 nt		3.67	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	REE1	YJL217W	597 nt		3.67	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	MRPL3	YMR024W	1173 nt		3.67	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	TMA108	YIL137C	2841 nt		3.67	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	PLM2	YDR501W	1566 nt		3.67	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	YMR018W	YMR018W	1545 nt		3.66	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	RCR2	YDR003W	633 nt		3.66	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	HAT2	YEL056W	1206 nt		3.66	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	ECO1	YFR027W	846 nt		3.66	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	PRP18	YGR006W	756 nt		3.66	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	YGR051C	YGR051C	324 nt		3.66	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	RPS4B	YHR203C	786 nt		3.66	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	tV(CAC)D	tV(CAC)D	73 nt		3.66	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	tV(CAC)H	tV(CAC)H	73 nt		3.66	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	RPS4A	YJR145C	786 nt		3.66	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	NEJ1	YLR265C	1029 nt		3.66	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	YLR365W	YLR365W	333 nt		3.66	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	MED11	YMR112C	396 nt		3.66	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	YNR071C	YNR071C	1029 nt		3.66	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	YOR186W	YOR186W	435 nt		3.66	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	USV1	YPL230W	1176 nt		3.66	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	APA1	YCL050C	966 nt		3.66	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	CET1	YPL228W	1650 nt		3.65	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	CAF130	YGR134W	3369 nt		3.65	□□□□□ -1.82
DSL1	P53847	CUP1-1	YHR053C	186 nt		3.65	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	CUP1-2	YHR055C	186 nt		3.65	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	SYC1	YOR179C	567 nt		3.65	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	RPS11B	YBR048W	471 nt		3.65	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	MNR2	YKL064W	2910 nt		3.65	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	CPA2	YJR109C	3357 nt		3.65	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	CWH43	YCR017C	2862 nt		3.65	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	MGA1	YGR249W	1371 nt		3.64	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	PFK26	YIL107C	2484 nt		3.64	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	ARO80	YDR421W	2853 nt		3.64	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	MIC60	YKR016W	1623 nt		3.64	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	FCF1	YDR339C	570 nt		3.64	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	YHI9	YHR029C	885 nt		3.64	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	YIR023C-A	YIR023C-A	324 nt		3.64	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	FIP1	YJR093C	984 nt		3.64	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	YMR010W	YMR010W	1218 nt		3.64	□□□□□ -1.83

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