Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
FOSBP53539 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOSBP53539 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOSBP53539 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOSBP53539 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOSBP53539 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOSBP53539 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOSBP53539 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOSBP53539 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOSBP53539 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
FOSBP53539 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOSBP53539 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOSBP53539 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOSBP53539 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOSBP53539 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOSBP53539 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOSBP53539 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOSBP53539 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
FOSBP53539 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOSBP53539 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
FOSBP53539 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOSBP53539 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOSBP53539 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOSBP53539 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOSBP53539 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOSBP53539 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOSBP53539 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOSBP53539 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOSBP53539 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOSBP53539 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOSBP53539 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOSBP53539 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOSBP53539 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
FOSBP53539 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOSBP53539 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOSBP53539 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOSBP53539 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOSBP53539 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
FOSBP53539 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOSBP53539 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOSBP53539 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOSBP53539 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOSBP53539 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOSBP53539 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FOSBP53539 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FOSBP53539 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FOSBP53539 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FOSBP53539 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOSBP53539 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOSBP53539 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOSBP53539 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOSBP53539 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOSBP53539 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOSBP53539 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOSBP53539 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOSBP53539 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOSBP53539 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOSBP53539 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOSBP53539 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOSBP53539 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOSBP53539 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOSBP53539 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOSBP53539 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOSBP53539 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOSBP53539 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOSBP53539 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOSBP53539 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOSBP53539 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOSBP53539 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOSBP53539 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOSBP53539 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOSBP53539 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOSBP53539 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOSBP53539 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOSBP53539 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOSBP53539 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOSBP53539 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
FOSBP53539 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOSBP53539 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOSBP53539 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOSBP53539 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOSBP53539 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOSBP53539 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOSBP53539 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOSBP53539 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOSBP53539 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
FOSBP53539 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOSBP53539 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOSBP53539 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOSBP53539 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOSBP53539 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOSBP53539 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOSBP53539 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOSBP53539 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOSBP53539 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOSBP53539 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOSBP53539 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOSBP53539 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOSBP53539 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOSBP53539 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms