Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ARFIP2P53365 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARFIP2P53365 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARFIP2P53365 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARFIP2P53365 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARFIP2P53365 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ARFIP2P53365 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARFIP2P53365 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARFIP2P53365 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARFIP2P53365 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARFIP2P53365 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARFIP2P53365 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARFIP2P53365 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARFIP2P53365 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARFIP2P53365 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARFIP2P53365 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARFIP2P53365 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARFIP2P53365 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARFIP2P53365 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARFIP2P53365 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARFIP2P53365 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARFIP2P53365 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARFIP2P53365 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARFIP2P53365 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARFIP2P53365 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARFIP2P53365 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARFIP2P53365 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARFIP2P53365 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARFIP2P53365 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARFIP2P53365 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARFIP2P53365 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARFIP2P53365 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARFIP2P53365 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARFIP2P53365 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARFIP2P53365 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARFIP2P53365 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARFIP2P53365 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARFIP2P53365 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARFIP2P53365 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARFIP2P53365 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARFIP2P53365 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARFIP2P53365 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARFIP2P53365 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARFIP2P53365 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARFIP2P53365 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARFIP2P53365 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARFIP2P53365 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ARFIP2P53365 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARFIP2P53365 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARFIP2P53365 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARFIP2P53365 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARFIP2P53365 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARFIP2P53365 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARFIP2P53365 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARFIP2P53365 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARFIP2P53365 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARFIP2P53365 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARFIP2P53365 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARFIP2P53365 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARFIP2P53365 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARFIP2P53365 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARFIP2P53365 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARFIP2P53365 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARFIP2P53365 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARFIP2P53365 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ARFIP2P53365 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARFIP2P53365 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARFIP2P53365 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARFIP2P53365 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARFIP2P53365 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARFIP2P53365 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms