Protein–RNA interactions for Protein: P52272

HNRNPM, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPMP52272 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.742e-7■■■■■ 28.3
HNRNPMP52272 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.882e-7■■■■■ 28.3
HNRNPMP52272 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.572e-7■■■■■ 28.3
HNRNPMP52272 KIZ-207ENST00000616679 3856 ntAPPRIS ALT2 TSL 510.57□□□□□ -0.721e-6■■■■■ 28.3
HNRNPMP52272 KIZ-214ENST00000621366 1397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)5.45□□□□□ -1.541e-6■■■■■ 28.3
HNRNPMP52272 KIZ-209ENST00000619179 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 54.22□□□□□ -1.731e-6■■■■■ 28.3
HNRNPMP52272 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.954e-8■■■■■ 28.3
HNRNPMP52272 PTP4A3-205ENST00000523147 558 ntTSL 533.27■■■□□ 2.924e-8■■■■■ 28.3
HNRNPMP52272 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.784e-8■■■■■ 28.3
HNRNPMP52272 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.444e-8■■■■■ 28.3
HNRNPMP52272 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.544e-8■■■■■ 28.3
HNRNPMP52272 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.364e-8■■■■■ 28.3
HNRNPMP52272 OSBPL6-209ENST00000477646 386 ntTSL 431.25■■■□□ 2.592e-8■■■■■ 28.3
HNRNPMP52272 METAP1-208ENST00000510209 559 ntTSL 426.84■■□□□ 1.892e-8■■■■■ 28.3
HNRNPMP52272 METAP1-205ENST00000507537 718 ntTSL 324.84■■□□□ 1.572e-8■■■■■ 28.3
HNRNPMP52272 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.232e-8■■■■■ 28.3
HNRNPMP52272 METAP1-202ENST00000503247 653 ntTSL 516.85■□□□□ 0.292e-8■■■■■ 28.3
HNRNPMP52272 METAP1-201ENST00000296411 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.152e-8■■■■■ 28.3
HNRNPMP52272 OSBPL6-205ENST00000392505 3637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.152e-8■■■■■ 28.3
HNRNPMP52272 OSBPL6-206ENST00000409045 3427 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.162e-8■■■■■ 28.3
HNRNPMP52272 METAP1-203ENST00000506238 553 ntTSL 413.46□□□□□ -0.252e-8■■■■■ 28.3
HNRNPMP52272 OSBPL6-204ENST00000359685 7114 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.282e-8■■■■■ 28.3
HNRNPMP52272 METAP1-212ENST00000625963 147 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.572e-8■■■■■ 28.3
HNRNPMP52272 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.452e-8■■■■■ 28.3
HNRNPMP52272 METAP1-206ENST00000510107 770 ntTSL 54.82□□□□□ -1.642e-8■■■■■ 28.3
HNRNPMP52272 MTND6P4-201ENST00000506002 522 ntBASIC19.7■□□□□ 0.742e-6■■■■■ 28.3
HNRNPMP52272 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.763e-6■■■■■ 28.3
HNRNPMP52272 SLC25A24P1-202ENST00000434803 1220 ntBASIC13.08□□□□□ -0.323e-6■■■■■ 28.3
HNRNPMP52272 GABRE-202ENST00000417300 619 ntTSL 217.61■□□□□ 0.412e-9■■■■■ 28.2
HNRNPMP52272 GABRE-203ENST00000441219 1324 ntTSL 214.76□□□□□ -0.052e-9■■■■■ 28.2
HNRNPMP52272 GABRE-201ENST00000370328 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.512e-9■■■■■ 28.2
HNRNPMP52272 DCAF6-206ENST00000455334 796 ntTSL 529.7■■■□□ 2.351e-6■■■■■ 28.2
HNRNPMP52272 DCAF6-205ENST00000450548 724 ntTSL 329.18■■■□□ 2.261e-6■■■■■ 28.2
HNRNPMP52272 DCAF6-208ENST00000470721 2803 ntTSL 223.42■■□□□ 1.341e-6■■■■■ 28.2
HNRNPMP52272 DCAF6-203ENST00000367843 3302 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.381e-6■■■■■ 28.2
HNRNPMP52272 DCAF6-204ENST00000432587 3522 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.341e-6■■■■■ 28.2
HNRNPMP52272 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.281e-6■■■■■ 28.2
HNRNPMP52272 DCAF6-202ENST00000367840 3349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.521e-6■■■■■ 28.2
HNRNPMP52272 DCAF6-209ENST00000470919 827 ntTSL 25.57□□□□□ -1.521e-6■■■■■ 28.2
HNRNPMP52272 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.395e-7■■■■■ 28.2
HNRNPMP52272 FBXO31-204ENST00000565593 2717 ntTSL 526.41■■□□□ 1.825e-7■■■■■ 28.2
HNRNPMP52272 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.425e-7■■■■■ 28.2
HNRNPMP52272 AUH-205ENST00000478465 751 ntTSL 333.29■■■□□ 2.928e-7■■■■■ 28.2
HNRNPMP52272 TBCD-207ENST00000571796 1940 ntTSL 1 (best)25.85■■□□□ 1.733e-7■■■■■ 28.2
HNRNPMP52272 TBCD-213ENST00000574422 879 ntTSL 217.41■□□□□ 0.383e-7■■■■■ 28.2
HNRNPMP52272 NSD2-208ENST00000420906 5109 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.721e-7■■■■■ 28.2
HNRNPMP52272 U2SURP-204ENST00000465175 571 ntTSL 45.48□□□□□ -1.538e-9■■■■■ 28.2
HNRNPMP52272 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.072e-6■■■■■ 28.2
HNRNPMP52272 PRKAR2B-202ENST00000393613 642 ntTSL 36.36□□□□□ -1.392e-6■■■■■ 28.2
HNRNPMP52272 PRKAR2B-203ENST00000488792 609 ntTSL 35.11□□□□□ -1.592e-6■■■■■ 28.2
HNRNPMP52272 MTA1-214ENST00000494026 852 ntTSL 528.43■■■□□ 2.141e-7■■■■■ 28.2
HNRNPMP52272 MTA1-216ENST00000498644 871 ntTSL 226.76■■□□□ 1.871e-7■■■■■ 28.2
HNRNPMP52272 NEDD4L-212ENST00000585594 220 ntTSL 1 (best)1.74□□□□□ -2.137e-7■■■■■ 28.2
HNRNPMP52272 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.664e-8■■■■■ 28.2
HNRNPMP52272 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.664e-8■■■■■ 28.2
HNRNPMP52272 SELENOO-202ENST00000492092 1626 ntTSL 1 (best)29.64■■■□□ 2.344e-8■■■■■ 28.2
HNRNPMP52272 TBCD-225ENST00000576996 827 ntTSL 523.21■■□□□ 1.311e-6■■■■■ 28.2
HNRNPMP52272 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.363e-7■■■■■ 28.2
HNRNPMP52272 IGF2R-201ENST00000356956 14044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.981e-6■■■■■ 28.1
HNRNPMP52272 PHKB-214ENST00000567402 1617 ntTSL 1 (best)15.27■□□□□ 0.035e-7■■■■■ 28.1
HNRNPMP52272 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.355e-7■■■■■ 28.1
HNRNPMP52272 DCTN5-202ENST00000563188 547 ntTSL 528.07■■■□□ 2.085e-7■■■■■ 28.1
HNRNPMP52272 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.175e-7■■■■■ 28.1
HNRNPMP52272 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.815e-7■■■■■ 28.1
HNRNPMP52272 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.675e-7■■■■■ 28.1
HNRNPMP52272 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.625e-7■■■■■ 28.1
HNRNPMP52272 ATP2C1-221ENST00000513801 3439 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.045e-7■■■■■ 28.1
HNRNPMP52272 DCTN5-204ENST00000563998 878 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -05e-7■■■■■ 28.1
HNRNPMP52272 DCTN5-205ENST00000566053 571 ntTSL 414.93□□□□□ -0.025e-7■■■■■ 28.1
HNRNPMP52272 ATP2C1-204ENST00000428331 4795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.175e-7■■■■■ 28.1
HNRNPMP52272 ATP2C1-215ENST00000508660 943 ntTSL 511.66□□□□□ -0.545e-7■■■■■ 28.1
HNRNPMP52272 DCTN5-206ENST00000566298 744 ntTSL 411.41□□□□□ -0.585e-7■■■■■ 28.1
HNRNPMP52272 DCTN5-207ENST00000568272 523 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.595e-7■■■■■ 28.1
HNRNPMP52272 ATP2C1-208ENST00000504948 4714 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.885e-7■■■■■ 28.1
HNRNPMP52272 ATP2C1-219ENST00000510774 555 ntTSL 49.01□□□□□ -0.975e-7■■■■■ 28.1
HNRNPMP52272 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -15e-7■■■■■ 28.1
HNRNPMP52272 ATP2C1-222ENST00000514654 4730 ntTSL 1 (best)8.18□□□□□ -1.15e-7■■■■■ 28.1
HNRNPMP52272 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.115e-7■■■■■ 28.1
HNRNPMP52272 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.275e-7■■■■■ 28.1
HNRNPMP52272 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.345e-7■■■■■ 28.1
HNRNPMP52272 ATP2C1-207ENST00000504612 3148 ntTSL 26.47□□□□□ -1.375e-7■■■■■ 28.1
HNRNPMP52272 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.385e-7■■■■■ 28.1
HNRNPMP52272 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.575e-7■■■■■ 28.1
HNRNPMP52272 ATP2C1-206ENST00000504571 786 ntTSL 34.13□□□□□ -1.755e-7■■■■■ 28.1
HNRNPMP52272 ZCCHC7-201ENST00000322831 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.871e-6■■■■■ 28.1
HNRNPMP52272 ZCCHC7-203ENST00000461038 2793 ntTSL 1 (best)19.91■□□□□ 0.781e-6■■■■■ 28.1
HNRNPMP52272 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.781e-6■■■■■ 28.1
HNRNPMP52272 ZCCHC7-206ENST00000488607 884 ntTSL 29.3□□□□□ -0.921e-6■■■■■ 28.1
HNRNPMP52272 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.541e-6■■■■■ 28.1
HNRNPMP52272 DLG1-212ENST00000436682 543 ntTSL 223.89■■□□□ 1.412e-7■■■■■ 28.1
HNRNPMP52272 DLG1-209ENST00000419553 582 ntTSL 219.57■□□□□ 0.722e-7■■■■■ 28.1
HNRNPMP52272 DLG1-226ENST00000485409 656 ntTSL 35.92□□□□□ -1.462e-7■■■■■ 28.1
HNRNPMP52272 PHF21A-211ENST00000529734 557 ntTSL 421.39■■□□□ 1.012e-6■■■■■ 28.1
HNRNPMP52272 PHF21A-202ENST00000418153 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.242e-6■■■■■ 28.1
HNRNPMP52272 PHF21A-201ENST00000323180 3675 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.692e-6■■■■■ 28.1
HNRNPMP52272 PHF21A-218ENST00000532883 1051 ntTSL 510.29□□□□□ -0.762e-6■■■■■ 28.1
HNRNPMP52272 PHF21A-219ENST00000533757 466 ntTSL 55.82□□□□□ -1.482e-6■■■■■ 28.1
HNRNPMP52272 PHF21A-216ENST00000532010 546 ntTSL 45.58□□□□□ -1.522e-6■■■■■ 28.1
HNRNPMP52272 PHF21A-209ENST00000527782 490 ntTSL 45.22□□□□□ -1.572e-6■■■■■ 28.1
HNRNPMP52272 PHF21A-212ENST00000529782 561 ntTSL 45.14□□□□□ -1.592e-6■■■■■ 28.1
Retrieved 100 of 21,363 protein–RNA pairs in 495.4 ms