Protein–RNA interactions for Protein: P51677

CCR3, C-C chemokine receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR3P51677 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCR3P51677 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCR3P51677 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCR3P51677 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCR3P51677 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCR3P51677 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCR3P51677 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCR3P51677 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCR3P51677 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCR3P51677 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCR3P51677 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCR3P51677 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCR3P51677 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCR3P51677 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCR3P51677 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCR3P51677 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCR3P51677 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCR3P51677 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCR3P51677 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCR3P51677 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCR3P51677 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCR3P51677 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCR3P51677 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCR3P51677 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCR3P51677 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCR3P51677 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCR3P51677 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCR3P51677 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCR3P51677 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCR3P51677 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCR3P51677 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCR3P51677 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCR3P51677 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCR3P51677 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCR3P51677 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCR3P51677 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCR3P51677 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCR3P51677 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCR3P51677 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCR3P51677 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCR3P51677 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCR3P51677 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCR3P51677 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCR3P51677 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCR3P51677 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCR3P51677 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCR3P51677 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCR3P51677 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCR3P51677 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCR3P51677 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCR3P51677 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCR3P51677 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCR3P51677 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCR3P51677 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCR3P51677 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCR3P51677 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCR3P51677 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCR3P51677 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCR3P51677 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCR3P51677 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCR3P51677 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCR3P51677 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCR3P51677 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCR3P51677 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCR3P51677 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCR3P51677 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCR3P51677 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCR3P51677 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCR3P51677 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCR3P51677 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCR3P51677 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCR3P51677 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCR3P51677 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCR3P51677 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCR3P51677 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCR3P51677 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCR3P51677 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCR3P51677 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCR3P51677 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCR3P51677 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCR3P51677 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCR3P51677 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCR3P51677 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCR3P51677 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCR3P51677 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCR3P51677 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCR3P51677 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCR3P51677 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCR3P51677 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCR3P51677 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCR3P51677 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCR3P51677 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCR3P51677 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCR3P51677 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCR3P51677 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCR3P51677 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCR3P51677 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCR3P51677 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCR3P51677 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCR3P51677 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms