Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RORCP51449 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RORCP51449 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RORCP51449 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RORCP51449 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RORCP51449 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RORCP51449 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RORCP51449 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RORCP51449 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RORCP51449 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RORCP51449 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RORCP51449 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RORCP51449 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RORCP51449 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RORCP51449 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RORCP51449 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RORCP51449 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RORCP51449 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RORCP51449 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RORCP51449 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RORCP51449 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RORCP51449 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RORCP51449 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RORCP51449 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RORCP51449 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RORCP51449 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RORCP51449 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RORCP51449 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RORCP51449 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
RORCP51449 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RORCP51449 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RORCP51449 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RORCP51449 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RORCP51449 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RORCP51449 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RORCP51449 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RORCP51449 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RORCP51449 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RORCP51449 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RORCP51449 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RORCP51449 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RORCP51449 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RORCP51449 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RORCP51449 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RORCP51449 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RORCP51449 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RORCP51449 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RORCP51449 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RORCP51449 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RORCP51449 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RORCP51449 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RORCP51449 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RORCP51449 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RORCP51449 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RORCP51449 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RORCP51449 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RORCP51449 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RORCP51449 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RORCP51449 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RORCP51449 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RORCP51449 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RORCP51449 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RORCP51449 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RORCP51449 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RORCP51449 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RORCP51449 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RORCP51449 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RORCP51449 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RORCP51449 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RORCP51449 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RORCP51449 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RORCP51449 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RORCP51449 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RORCP51449 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RORCP51449 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RORCP51449 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RORCP51449 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RORCP51449 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RORCP51449 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RORCP51449 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RORCP51449 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RORCP51449 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RORCP51449 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RORCP51449 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RORCP51449 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RORCP51449 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RORCP51449 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RORCP51449 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RORCP51449 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RORCP51449 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RORCP51449 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RORCP51449 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RORCP51449 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RORCP51449 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RORCP51449 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RORCP51449 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RORCP51449 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RORCP51449 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RORCP51449 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RORCP51449 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms