Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CSRP3P50461 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms