Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
NUP153P49790 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
NUP153P49790 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
NUP153P49790 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
NUP153P49790 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
NUP153P49790 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
NUP153P49790 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
NUP153P49790 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
NUP153P49790 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC33.87■■■■□ 3.01
NUP153P49790 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
NUP153P49790 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
NUP153P49790 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
NUP153P49790 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
NUP153P49790 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
NUP153P49790 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
NUP153P49790 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
NUP153P49790 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
NUP153P49790 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NUP153P49790 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NUP153P49790 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NUP153P49790 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NUP153P49790 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
NUP153P49790 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NUP153P49790 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NUP153P49790 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
NUP153P49790 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
NUP153P49790 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
NUP153P49790 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NUP153P49790 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
NUP153P49790 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
NUP153P49790 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NUP153P49790 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NUP153P49790 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NUP153P49790 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NUP153P49790 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NUP153P49790 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
NUP153P49790 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
NUP153P49790 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
NUP153P49790 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NUP153P49790 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NUP153P49790 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NUP153P49790 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NUP153P49790 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NUP153P49790 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NUP153P49790 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
NUP153P49790 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
NUP153P49790 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC33.82■■■■□ 3
NUP153P49790 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
NUP153P49790 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
NUP153P49790 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC33.82■■■■□ 3
NUP153P49790 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
NUP153P49790 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NUP153P49790 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
NUP153P49790 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NUP153P49790 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NUP153P49790 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
NUP153P49790 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NUP153P49790 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
NUP153P49790 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC33.81■■■■□ 3
NUP153P49790 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
NUP153P49790 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NUP153P49790 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
NUP153P49790 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NUP153P49790 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NUP153P49790 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC33.8■■■■□ 3
NUP153P49790 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC33.8■■■■□ 3
NUP153P49790 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC33.79■■■■□ 3
NUP153P49790 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NUP153P49790 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
NUP153P49790 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC33.79■■■■□ 3
NUP153P49790 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
NUP153P49790 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NUP153P49790 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
NUP153P49790 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
NUP153P49790 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NUP153P49790 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NUP153P49790 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NUP153P49790 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NUP153P49790 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC33.78■■■■□ 3
NUP153P49790 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC33.78■■■■□ 3
NUP153P49790 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
NUP153P49790 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NUP153P49790 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC33.78■■■■□ 3
NUP153P49790 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NUP153P49790 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
NUP153P49790 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
NUP153P49790 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
NUP153P49790 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NUP153P49790 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.76■■■■□ 3
NUP153P49790 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
NUP153P49790 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
NUP153P49790 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
NUP153P49790 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
NUP153P49790 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
NUP153P49790 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
NUP153P49790 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
NUP153P49790 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC33.76■■■□□ 2.99
NUP153P49790 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC33.76■■■□□ 2.99
NUP153P49790 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
NUP153P49790 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms