Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KRT6CP48668 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KRT6CP48668 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KRT6CP48668 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KRT6CP48668 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KRT6CP48668 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KRT6CP48668 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KRT6CP48668 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KRT6CP48668 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KRT6CP48668 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KRT6CP48668 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KRT6CP48668 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KRT6CP48668 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KRT6CP48668 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KRT6CP48668 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KRT6CP48668 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KRT6CP48668 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KRT6CP48668 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KRT6CP48668 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KRT6CP48668 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KRT6CP48668 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KRT6CP48668 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KRT6CP48668 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KRT6CP48668 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KRT6CP48668 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KRT6CP48668 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KRT6CP48668 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KRT6CP48668 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KRT6CP48668 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KRT6CP48668 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KRT6CP48668 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KRT6CP48668 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KRT6CP48668 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
KRT6CP48668 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
KRT6CP48668 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KRT6CP48668 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KRT6CP48668 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KRT6CP48668 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KRT6CP48668 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KRT6CP48668 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KRT6CP48668 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
KRT6CP48668 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KRT6CP48668 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
KRT6CP48668 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
KRT6CP48668 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KRT6CP48668 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KRT6CP48668 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KRT6CP48668 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KRT6CP48668 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
KRT6CP48668 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KRT6CP48668 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KRT6CP48668 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KRT6CP48668 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KRT6CP48668 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KRT6CP48668 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT6CP48668 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT6CP48668 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT6CP48668 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT6CP48668 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT6CP48668 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT6CP48668 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT6CP48668 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT6CP48668 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT6CP48668 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT6CP48668 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT6CP48668 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT6CP48668 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT6CP48668 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT6CP48668 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT6CP48668 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT6CP48668 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT6CP48668 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT6CP48668 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT6CP48668 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT6CP48668 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT6CP48668 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT6CP48668 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT6CP48668 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT6CP48668 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT6CP48668 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT6CP48668 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT6CP48668 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT6CP48668 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT6CP48668 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT6CP48668 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT6CP48668 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT6CP48668 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT6CP48668 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT6CP48668 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT6CP48668 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT6CP48668 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT6CP48668 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT6CP48668 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT6CP48668 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT6CP48668 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT6CP48668 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT6CP48668 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT6CP48668 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KRT6CP48668 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KRT6CP48668 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms