Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms