Protein–RNA interactions for Protein: P47895

ALDH1A3, Aldehyde dehydrogenase family 1 member A3, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A3P47895 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALDH1A3P47895 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALDH1A3P47895 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALDH1A3P47895 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALDH1A3P47895 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALDH1A3P47895 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ALDH1A3P47895 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALDH1A3P47895 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALDH1A3P47895 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALDH1A3P47895 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALDH1A3P47895 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ALDH1A3P47895 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALDH1A3P47895 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALDH1A3P47895 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALDH1A3P47895 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALDH1A3P47895 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALDH1A3P47895 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALDH1A3P47895 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALDH1A3P47895 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALDH1A3P47895 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ALDH1A3P47895 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ALDH1A3P47895 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALDH1A3P47895 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALDH1A3P47895 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALDH1A3P47895 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALDH1A3P47895 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALDH1A3P47895 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALDH1A3P47895 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALDH1A3P47895 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALDH1A3P47895 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALDH1A3P47895 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALDH1A3P47895 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALDH1A3P47895 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALDH1A3P47895 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALDH1A3P47895 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALDH1A3P47895 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALDH1A3P47895 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALDH1A3P47895 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALDH1A3P47895 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALDH1A3P47895 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALDH1A3P47895 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALDH1A3P47895 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALDH1A3P47895 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALDH1A3P47895 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALDH1A3P47895 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALDH1A3P47895 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALDH1A3P47895 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALDH1A3P47895 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALDH1A3P47895 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALDH1A3P47895 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALDH1A3P47895 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALDH1A3P47895 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALDH1A3P47895 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALDH1A3P47895 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ALDH1A3P47895 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALDH1A3P47895 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALDH1A3P47895 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALDH1A3P47895 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALDH1A3P47895 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALDH1A3P47895 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ALDH1A3P47895 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALDH1A3P47895 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALDH1A3P47895 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALDH1A3P47895 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALDH1A3P47895 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALDH1A3P47895 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALDH1A3P47895 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALDH1A3P47895 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALDH1A3P47895 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALDH1A3P47895 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ALDH1A3P47895 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALDH1A3P47895 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ALDH1A3P47895 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALDH1A3P47895 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALDH1A3P47895 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALDH1A3P47895 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALDH1A3P47895 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALDH1A3P47895 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALDH1A3P47895 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALDH1A3P47895 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALDH1A3P47895 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALDH1A3P47895 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALDH1A3P47895 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALDH1A3P47895 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALDH1A3P47895 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALDH1A3P47895 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALDH1A3P47895 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ALDH1A3P47895 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALDH1A3P47895 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALDH1A3P47895 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALDH1A3P47895 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALDH1A3P47895 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALDH1A3P47895 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ALDH1A3P47895 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALDH1A3P47895 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALDH1A3P47895 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ALDH1A3P47895 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALDH1A3P47895 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALDH1A3P47895 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALDH1A3P47895 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms