Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACADSBP45954 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACADSBP45954 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACADSBP45954 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACADSBP45954 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACADSBP45954 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACADSBP45954 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACADSBP45954 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACADSBP45954 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACADSBP45954 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACADSBP45954 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACADSBP45954 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACADSBP45954 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACADSBP45954 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACADSBP45954 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACADSBP45954 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACADSBP45954 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACADSBP45954 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACADSBP45954 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ACADSBP45954 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACADSBP45954 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACADSBP45954 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACADSBP45954 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACADSBP45954 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACADSBP45954 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACADSBP45954 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACADSBP45954 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACADSBP45954 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACADSBP45954 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACADSBP45954 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACADSBP45954 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACADSBP45954 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACADSBP45954 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACADSBP45954 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACADSBP45954 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACADSBP45954 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ACADSBP45954 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACADSBP45954 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACADSBP45954 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACADSBP45954 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ACADSBP45954 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACADSBP45954 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACADSBP45954 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACADSBP45954 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACADSBP45954 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACADSBP45954 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACADSBP45954 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACADSBP45954 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACADSBP45954 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACADSBP45954 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACADSBP45954 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACADSBP45954 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACADSBP45954 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACADSBP45954 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACADSBP45954 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACADSBP45954 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACADSBP45954 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACADSBP45954 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACADSBP45954 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACADSBP45954 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACADSBP45954 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACADSBP45954 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACADSBP45954 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACADSBP45954 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACADSBP45954 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACADSBP45954 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACADSBP45954 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACADSBP45954 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACADSBP45954 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACADSBP45954 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACADSBP45954 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACADSBP45954 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACADSBP45954 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACADSBP45954 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACADSBP45954 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ACADSBP45954 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms