Protein–RNA interactions for Protein: P45378

TNNT3, Troponin T, fast skeletal muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3P45378 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms