Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TGFBR1P36897 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms