Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COPB2P35606 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COPB2P35606 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COPB2P35606 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COPB2P35606 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COPB2P35606 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COPB2P35606 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COPB2P35606 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COPB2P35606 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COPB2P35606 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COPB2P35606 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COPB2P35606 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COPB2P35606 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COPB2P35606 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COPB2P35606 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COPB2P35606 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COPB2P35606 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COPB2P35606 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COPB2P35606 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COPB2P35606 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COPB2P35606 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COPB2P35606 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COPB2P35606 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COPB2P35606 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COPB2P35606 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COPB2P35606 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COPB2P35606 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COPB2P35606 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COPB2P35606 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COPB2P35606 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COPB2P35606 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COPB2P35606 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
COPB2P35606 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
COPB2P35606 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COPB2P35606 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COPB2P35606 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COPB2P35606 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COPB2P35606 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COPB2P35606 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COPB2P35606 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COPB2P35606 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COPB2P35606 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COPB2P35606 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COPB2P35606 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
COPB2P35606 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COPB2P35606 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COPB2P35606 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
COPB2P35606 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COPB2P35606 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COPB2P35606 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COPB2P35606 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COPB2P35606 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COPB2P35606 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COPB2P35606 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COPB2P35606 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COPB2P35606 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
COPB2P35606 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
COPB2P35606 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
COPB2P35606 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COPB2P35606 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COPB2P35606 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
COPB2P35606 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
COPB2P35606 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COPB2P35606 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COPB2P35606 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
COPB2P35606 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
COPB2P35606 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COPB2P35606 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COPB2P35606 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COPB2P35606 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COPB2P35606 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COPB2P35606 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COPB2P35606 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COPB2P35606 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COPB2P35606 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COPB2P35606 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COPB2P35606 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COPB2P35606 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
COPB2P35606 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COPB2P35606 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COPB2P35606 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COPB2P35606 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COPB2P35606 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
COPB2P35606 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COPB2P35606 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COPB2P35606 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COPB2P35606 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COPB2P35606 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
COPB2P35606 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
COPB2P35606 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COPB2P35606 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COPB2P35606 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COPB2P35606 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COPB2P35606 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COPB2P35606 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COPB2P35606 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COPB2P35606 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COPB2P35606 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COPB2P35606 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COPB2P35606 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms