Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTNNA1P35221 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms