Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PLNP26678 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLNP26678 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLNP26678 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLNP26678 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLNP26678 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLNP26678 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLNP26678 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLNP26678 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLNP26678 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLNP26678 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLNP26678 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLNP26678 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLNP26678 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLNP26678 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLNP26678 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLNP26678 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLNP26678 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLNP26678 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLNP26678 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLNP26678 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLNP26678 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLNP26678 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLNP26678 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLNP26678 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLNP26678 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLNP26678 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PLNP26678 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PLNP26678 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PLNP26678 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PLNP26678 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PLNP26678 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PLNP26678 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PLNP26678 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PLNP26678 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PLNP26678 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PLNP26678 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PLNP26678 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PLNP26678 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PLNP26678 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PLNP26678 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PLNP26678 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PLNP26678 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PLNP26678 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PLNP26678 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PLNP26678 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PLNP26678 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PLNP26678 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PLNP26678 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PLNP26678 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PLNP26678 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PLNP26678 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PLNP26678 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PLNP26678 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PLNP26678 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PLNP26678 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PLNP26678 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PLNP26678 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PLNP26678 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PLNP26678 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PLNP26678 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PLNP26678 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PLNP26678 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PLNP26678 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PLNP26678 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PLNP26678 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PLNP26678 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PLNP26678 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PLNP26678 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PLNP26678 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLNP26678 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLNP26678 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLNP26678 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLNP26678 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLNP26678 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLNP26678 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLNP26678 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLNP26678 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLNP26678 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLNP26678 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLNP26678 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLNP26678 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PLNP26678 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLNP26678 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLNP26678 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLNP26678 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLNP26678 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLNP26678 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLNP26678 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLNP26678 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLNP26678 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLNP26678 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLNP26678 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLNP26678 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLNP26678 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLNP26678 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PLNP26678 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLNP26678 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLNP26678 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLNP26678 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms