Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms