Protein–RNA interactions for Protein: P24046

GABRR1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-1, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR1P24046 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRR1P24046 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms