Protein–RNA interactions for Protein: P18850

ATF6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF6P18850 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATF6P18850 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATF6P18850 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATF6P18850 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATF6P18850 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATF6P18850 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATF6P18850 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATF6P18850 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATF6P18850 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATF6P18850 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATF6P18850 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATF6P18850 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATF6P18850 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATF6P18850 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATF6P18850 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATF6P18850 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATF6P18850 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATF6P18850 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATF6P18850 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATF6P18850 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATF6P18850 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF6P18850 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF6P18850 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF6P18850 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF6P18850 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF6P18850 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF6P18850 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF6P18850 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF6P18850 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF6P18850 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF6P18850 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF6P18850 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF6P18850 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF6P18850 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF6P18850 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF6P18850 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF6P18850 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF6P18850 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF6P18850 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF6P18850 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF6P18850 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF6P18850 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF6P18850 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF6P18850 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF6P18850 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF6P18850 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF6P18850 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF6P18850 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF6P18850 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATF6P18850 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATF6P18850 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATF6P18850 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATF6P18850 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATF6P18850 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATF6P18850 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATF6P18850 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATF6P18850 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATF6P18850 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATF6P18850 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATF6P18850 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATF6P18850 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATF6P18850 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF6P18850 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF6P18850 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF6P18850 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF6P18850 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF6P18850 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF6P18850 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF6P18850 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF6P18850 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF6P18850 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ATF6P18850 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATF6P18850 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATF6P18850 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATF6P18850 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ATF6P18850 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATF6P18850 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATF6P18850 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATF6P18850 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATF6P18850 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATF6P18850 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATF6P18850 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATF6P18850 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATF6P18850 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ATF6P18850 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATF6P18850 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATF6P18850 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATF6P18850 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATF6P18850 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATF6P18850 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATF6P18850 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ATF6P18850 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATF6P18850 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATF6P18850 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ATF6P18850 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATF6P18850 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATF6P18850 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ATF6P18850 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATF6P18850 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATF6P18850 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms