Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms