Protein–RNA interactions for Protein: P18507

GABRG2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRG2P18507 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRG2P18507 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRG2P18507 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRG2P18507 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRG2P18507 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRG2P18507 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRG2P18507 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRG2P18507 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRG2P18507 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRG2P18507 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRG2P18507 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRG2P18507 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRG2P18507 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRG2P18507 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRG2P18507 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRG2P18507 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRG2P18507 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GABRG2P18507 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GABRG2P18507 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GABRG2P18507 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GABRG2P18507 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GABRG2P18507 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GABRG2P18507 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GABRG2P18507 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GABRG2P18507 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GABRG2P18507 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GABRG2P18507 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GABRG2P18507 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GABRG2P18507 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GABRG2P18507 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GABRG2P18507 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRG2P18507 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRG2P18507 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRG2P18507 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRG2P18507 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRG2P18507 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRG2P18507 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRG2P18507 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRG2P18507 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRG2P18507 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRG2P18507 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRG2P18507 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABRG2P18507 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GABRG2P18507 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABRG2P18507 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABRG2P18507 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABRG2P18507 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABRG2P18507 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GABRG2P18507 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABRG2P18507 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABRG2P18507 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GABRG2P18507 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABRG2P18507 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABRG2P18507 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABRG2P18507 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABRG2P18507 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABRG2P18507 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABRG2P18507 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABRG2P18507 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABRG2P18507 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABRG2P18507 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABRG2P18507 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABRG2P18507 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABRG2P18507 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABRG2P18507 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABRG2P18507 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABRG2P18507 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABRG2P18507 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABRG2P18507 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABRG2P18507 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABRG2P18507 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABRG2P18507 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABRG2P18507 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABRG2P18507 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABRG2P18507 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABRG2P18507 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABRG2P18507 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABRG2P18507 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABRG2P18507 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GABRG2P18507 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABRG2P18507 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABRG2P18507 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABRG2P18507 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABRG2P18507 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABRG2P18507 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABRG2P18507 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABRG2P18507 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABRG2P18507 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABRG2P18507 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABRG2P18507 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABRG2P18507 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABRG2P18507 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABRG2P18507 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABRG2P18507 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GABRG2P18507 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GABRG2P18507 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABRG2P18507 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABRG2P18507 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABRG2P18507 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABRG2P18507 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms