Protein–RNA interactions for Protein: P17544

ATF7, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7P17544 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ATF7P17544 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATF7P17544 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATF7P17544 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATF7P17544 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATF7P17544 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATF7P17544 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATF7P17544 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATF7P17544 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATF7P17544 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATF7P17544 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATF7P17544 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATF7P17544 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATF7P17544 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ATF7P17544 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATF7P17544 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ATF7P17544 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATF7P17544 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATF7P17544 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATF7P17544 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATF7P17544 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATF7P17544 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATF7P17544 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATF7P17544 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATF7P17544 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATF7P17544 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATF7P17544 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATF7P17544 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATF7P17544 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATF7P17544 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATF7P17544 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATF7P17544 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATF7P17544 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATF7P17544 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATF7P17544 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATF7P17544 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ATF7P17544 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATF7P17544 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATF7P17544 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATF7P17544 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATF7P17544 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATF7P17544 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATF7P17544 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF7P17544 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF7P17544 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF7P17544 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF7P17544 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF7P17544 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF7P17544 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF7P17544 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF7P17544 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF7P17544 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF7P17544 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF7P17544 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF7P17544 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF7P17544 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF7P17544 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF7P17544 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF7P17544 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF7P17544 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF7P17544 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF7P17544 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF7P17544 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF7P17544 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF7P17544 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF7P17544 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF7P17544 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF7P17544 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF7P17544 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF7P17544 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF7P17544 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF7P17544 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF7P17544 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF7P17544 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF7P17544 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF7P17544 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF7P17544 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF7P17544 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF7P17544 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF7P17544 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF7P17544 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF7P17544 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATF7P17544 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATF7P17544 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATF7P17544 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ATF7P17544 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATF7P17544 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATF7P17544 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATF7P17544 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATF7P17544 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATF7P17544 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATF7P17544 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATF7P17544 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATF7P17544 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ATF7P17544 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATF7P17544 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATF7P17544 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATF7P17544 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATF7P17544 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATF7P17544 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms