Protein–RNA interactions for Protein: P17096

HMGA1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGA1P17096 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGA1P17096 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGA1P17096 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGA1P17096 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMGA1P17096 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMGA1P17096 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMGA1P17096 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMGA1P17096 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMGA1P17096 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HMGA1P17096 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMGA1P17096 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMGA1P17096 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMGA1P17096 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMGA1P17096 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGA1P17096 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGA1P17096 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGA1P17096 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGA1P17096 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGA1P17096 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGA1P17096 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGA1P17096 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGA1P17096 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGA1P17096 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGA1P17096 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGA1P17096 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGA1P17096 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGA1P17096 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGA1P17096 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGA1P17096 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGA1P17096 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGA1P17096 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGA1P17096 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGA1P17096 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGA1P17096 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGA1P17096 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGA1P17096 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGA1P17096 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGA1P17096 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGA1P17096 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGA1P17096 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGA1P17096 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGA1P17096 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGA1P17096 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGA1P17096 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGA1P17096 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGA1P17096 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGA1P17096 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGA1P17096 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGA1P17096 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGA1P17096 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGA1P17096 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGA1P17096 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGA1P17096 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGA1P17096 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGA1P17096 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGA1P17096 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGA1P17096 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGA1P17096 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGA1P17096 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGA1P17096 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGA1P17096 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGA1P17096 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGA1P17096 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGA1P17096 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGA1P17096 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGA1P17096 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HMGA1P17096 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HMGA1P17096 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms