Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPCAMP16422 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPCAMP16422 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPCAMP16422 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPCAMP16422 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EPCAMP16422 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPCAMP16422 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPCAMP16422 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPCAMP16422 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPCAMP16422 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPCAMP16422 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPCAMP16422 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
EPCAMP16422 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPCAMP16422 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPCAMP16422 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPCAMP16422 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPCAMP16422 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPCAMP16422 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPCAMP16422 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPCAMP16422 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPCAMP16422 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
EPCAMP16422 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPCAMP16422 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPCAMP16422 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPCAMP16422 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPCAMP16422 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPCAMP16422 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPCAMP16422 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EPCAMP16422 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPCAMP16422 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPCAMP16422 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPCAMP16422 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPCAMP16422 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPCAMP16422 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPCAMP16422 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPCAMP16422 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPCAMP16422 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPCAMP16422 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EPCAMP16422 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPCAMP16422 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPCAMP16422 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPCAMP16422 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPCAMP16422 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPCAMP16422 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPCAMP16422 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EPCAMP16422 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPCAMP16422 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPCAMP16422 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPCAMP16422 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPCAMP16422 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPCAMP16422 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPCAMP16422 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPCAMP16422 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPCAMP16422 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
EPCAMP16422 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPCAMP16422 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPCAMP16422 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPCAMP16422 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPCAMP16422 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EPCAMP16422 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EPCAMP16422 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPCAMP16422 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms