Protein–RNA interactions for Protein: P15085

CPA1, Carboxypeptidase A1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA1P15085 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CPA1P15085 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CPA1P15085 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
CPA1P15085 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CPA1P15085 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CPA1P15085 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CPA1P15085 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CPA1P15085 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CPA1P15085 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CPA1P15085 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CPA1P15085 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CPA1P15085 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CPA1P15085 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CPA1P15085 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CPA1P15085 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CPA1P15085 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CPA1P15085 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CPA1P15085 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CPA1P15085 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPA1P15085 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPA1P15085 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPA1P15085 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPA1P15085 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPA1P15085 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPA1P15085 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPA1P15085 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPA1P15085 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPA1P15085 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPA1P15085 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPA1P15085 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CPA1P15085 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CPA1P15085 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CPA1P15085 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CPA1P15085 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CPA1P15085 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPA1P15085 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPA1P15085 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPA1P15085 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPA1P15085 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CPA1P15085 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPA1P15085 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPA1P15085 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPA1P15085 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPA1P15085 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPA1P15085 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPA1P15085 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPA1P15085 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPA1P15085 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPA1P15085 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPA1P15085 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPA1P15085 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CPA1P15085 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CPA1P15085 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CPA1P15085 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CPA1P15085 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CPA1P15085 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CPA1P15085 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CPA1P15085 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CPA1P15085 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CPA1P15085 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CPA1P15085 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CPA1P15085 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CPA1P15085 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CPA1P15085 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CPA1P15085 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CPA1P15085 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CPA1P15085 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CPA1P15085 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CPA1P15085 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CPA1P15085 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CPA1P15085 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CPA1P15085 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CPA1P15085 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CPA1P15085 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CPA1P15085 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CPA1P15085 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CPA1P15085 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CPA1P15085 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CPA1P15085 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CPA1P15085 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CPA1P15085 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CPA1P15085 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CPA1P15085 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CPA1P15085 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CPA1P15085 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CPA1P15085 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CPA1P15085 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CPA1P15085 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CPA1P15085 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CPA1P15085 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CPA1P15085 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CPA1P15085 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CPA1P15085 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CPA1P15085 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CPA1P15085 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CPA1P15085 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CPA1P15085 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CPA1P15085 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CPA1P15085 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CPA1P15085 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms