Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNT1P13805 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNT1P13805 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNT1P13805 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNT1P13805 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNT1P13805 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNT1P13805 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNT1P13805 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNT1P13805 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNT1P13805 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNT1P13805 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNT1P13805 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNT1P13805 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNT1P13805 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNT1P13805 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNT1P13805 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNT1P13805 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNT1P13805 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNT1P13805 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNT1P13805 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNT1P13805 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNT1P13805 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNT1P13805 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNT1P13805 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNT1P13805 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNT1P13805 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNT1P13805 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNT1P13805 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNT1P13805 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNT1P13805 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNT1P13805 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNT1P13805 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNT1P13805 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNT1P13805 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNT1P13805 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNT1P13805 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNT1P13805 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNT1P13805 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNT1P13805 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNT1P13805 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNT1P13805 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNT1P13805 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNT1P13805 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNT1P13805 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNT1P13805 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNT1P13805 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNT1P13805 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNT1P13805 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
TNNT1P13805 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNT1P13805 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNT1P13805 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNT1P13805 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNT1P13805 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNT1P13805 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNT1P13805 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNT1P13805 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNT1P13805 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNT1P13805 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNT1P13805 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNT1P13805 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNT1P13805 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNT1P13805 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNT1P13805 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNT1P13805 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNT1P13805 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNT1P13805 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNT1P13805 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNT1P13805 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNT1P13805 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNT1P13805 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNT1P13805 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNT1P13805 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNT1P13805 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNT1P13805 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNT1P13805 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNT1P13805 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNT1P13805 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNT1P13805 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNT1P13805 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNT1P13805 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNT1P13805 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNT1P13805 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNT1P13805 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNT1P13805 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNT1P13805 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNT1P13805 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNT1P13805 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNT1P13805 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNT1P13805 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNT1P13805 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNT1P13805 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNT1P13805 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNT1P13805 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNT1P13805 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNT1P13805 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNT1P13805 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNT1P13805 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNT1P13805 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNT1P13805 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNT1P13805 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms