Protein–RNA interactions for Protein: P11216

PYGB, Glycogen phosphorylase, brain form, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYGBP11216 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PYGBP11216 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PYGBP11216 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PYGBP11216 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PYGBP11216 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PYGBP11216 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PYGBP11216 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PYGBP11216 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PYGBP11216 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PYGBP11216 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PYGBP11216 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PYGBP11216 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PYGBP11216 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PYGBP11216 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PYGBP11216 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PYGBP11216 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PYGBP11216 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PYGBP11216 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PYGBP11216 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PYGBP11216 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PYGBP11216 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PYGBP11216 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PYGBP11216 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PYGBP11216 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PYGBP11216 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PYGBP11216 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PYGBP11216 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PYGBP11216 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PYGBP11216 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PYGBP11216 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PYGBP11216 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PYGBP11216 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PYGBP11216 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PYGBP11216 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PYGBP11216 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PYGBP11216 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PYGBP11216 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PYGBP11216 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PYGBP11216 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PYGBP11216 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PYGBP11216 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PYGBP11216 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PYGBP11216 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PYGBP11216 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PYGBP11216 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PYGBP11216 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PYGBP11216 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PYGBP11216 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PYGBP11216 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PYGBP11216 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PYGBP11216 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PYGBP11216 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PYGBP11216 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PYGBP11216 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PYGBP11216 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PYGBP11216 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PYGBP11216 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PYGBP11216 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PYGBP11216 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PYGBP11216 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PYGBP11216 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PYGBP11216 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PYGBP11216 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PYGBP11216 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PYGBP11216 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PYGBP11216 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PYGBP11216 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PYGBP11216 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PYGBP11216 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PYGBP11216 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PYGBP11216 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PYGBP11216 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PYGBP11216 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PYGBP11216 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PYGBP11216 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PYGBP11216 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PYGBP11216 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PYGBP11216 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PYGBP11216 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PYGBP11216 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PYGBP11216 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PYGBP11216 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PYGBP11216 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PYGBP11216 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PYGBP11216 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PYGBP11216 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PYGBP11216 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PYGBP11216 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PYGBP11216 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PYGBP11216 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PYGBP11216 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PYGBP11216 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PYGBP11216 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PYGBP11216 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PYGBP11216 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PYGBP11216 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PYGBP11216 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PYGBP11216 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PYGBP11216 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PYGBP11216 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms