Protein–RNA interactions for Protein: P10276

RARA, Retinoic acid receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARAP10276 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RARAP10276 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RARAP10276 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RARAP10276 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RARAP10276 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RARAP10276 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RARAP10276 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RARAP10276 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RARAP10276 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RARAP10276 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RARAP10276 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RARAP10276 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RARAP10276 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RARAP10276 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RARAP10276 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RARAP10276 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RARAP10276 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RARAP10276 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RARAP10276 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RARAP10276 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RARAP10276 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RARAP10276 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RARAP10276 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RARAP10276 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RARAP10276 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RARAP10276 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RARAP10276 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RARAP10276 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RARAP10276 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RARAP10276 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RARAP10276 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RARAP10276 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RARAP10276 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RARAP10276 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RARAP10276 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RARAP10276 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RARAP10276 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RARAP10276 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RARAP10276 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RARAP10276 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RARAP10276 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RARAP10276 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RARAP10276 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RARAP10276 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RARAP10276 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RARAP10276 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RARAP10276 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RARAP10276 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RARAP10276 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RARAP10276 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RARAP10276 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RARAP10276 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RARAP10276 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RARAP10276 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RARAP10276 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RARAP10276 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RARAP10276 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RARAP10276 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RARAP10276 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RARAP10276 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RARAP10276 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RARAP10276 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RARAP10276 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RARAP10276 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RARAP10276 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RARAP10276 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RARAP10276 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RARAP10276 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RARAP10276 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RARAP10276 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RARAP10276 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RARAP10276 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RARAP10276 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RARAP10276 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RARAP10276 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RARAP10276 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RARAP10276 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RARAP10276 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RARAP10276 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RARAP10276 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RARAP10276 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RARAP10276 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RARAP10276 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RARAP10276 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RARAP10276 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RARAP10276 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RARAP10276 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RARAP10276 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RARAP10276 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RARAP10276 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RARAP10276 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RARAP10276 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RARAP10276 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RARAP10276 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RARAP10276 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RARAP10276 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RARAP10276 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RARAP10276 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RARAP10276 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RARAP10276 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms