Protein–RNA interactions for Protein: P10144

GZMB, Granzyme B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GZMBP10144 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GZMBP10144 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GZMBP10144 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GZMBP10144 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GZMBP10144 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GZMBP10144 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GZMBP10144 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GZMBP10144 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GZMBP10144 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GZMBP10144 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GZMBP10144 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GZMBP10144 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GZMBP10144 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GZMBP10144 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GZMBP10144 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GZMBP10144 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GZMBP10144 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GZMBP10144 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GZMBP10144 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GZMBP10144 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GZMBP10144 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GZMBP10144 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GZMBP10144 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GZMBP10144 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GZMBP10144 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GZMBP10144 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GZMBP10144 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GZMBP10144 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GZMBP10144 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GZMBP10144 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GZMBP10144 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GZMBP10144 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GZMBP10144 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GZMBP10144 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GZMBP10144 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GZMBP10144 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GZMBP10144 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GZMBP10144 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GZMBP10144 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GZMBP10144 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GZMBP10144 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GZMBP10144 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GZMBP10144 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GZMBP10144 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GZMBP10144 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GZMBP10144 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GZMBP10144 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GZMBP10144 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GZMBP10144 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GZMBP10144 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GZMBP10144 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GZMBP10144 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GZMBP10144 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GZMBP10144 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GZMBP10144 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GZMBP10144 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GZMBP10144 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GZMBP10144 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GZMBP10144 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GZMBP10144 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GZMBP10144 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GZMBP10144 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GZMBP10144 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GZMBP10144 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GZMBP10144 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GZMBP10144 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GZMBP10144 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GZMBP10144 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GZMBP10144 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GZMBP10144 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GZMBP10144 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GZMBP10144 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GZMBP10144 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GZMBP10144 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GZMBP10144 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GZMBP10144 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GZMBP10144 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GZMBP10144 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GZMBP10144 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GZMBP10144 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GZMBP10144 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
GZMBP10144 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GZMBP10144 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GZMBP10144 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GZMBP10144 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GZMBP10144 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GZMBP10144 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GZMBP10144 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GZMBP10144 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GZMBP10144 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GZMBP10144 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GZMBP10144 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GZMBP10144 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GZMBP10144 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GZMBP10144 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GZMBP10144 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GZMBP10144 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GZMBP10144 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GZMBP10144 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GZMBP10144 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms