Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC172P0C7W6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms